Het voornaamste activiteitsdomein betreft advies over de relatie tussen de kwaliteit van milieu en de gezondheid aan besturen, professionelen uit de gezondheids- of milieusector, NGO's en burgergroepen en individuele burgers:
- de kwaliteit van de omgevingslucht
- de kwaliteit van het drinkwater (leiding- en putwater)
- bodemverontreiniging
- ongezonde woningen
- zwembaden en open zwemgelegenheden
Om die activiteiten te kunnen uitvoeren, beschikt de afdeling over een buitendienst in elke provincie. Vele tussenkomsten gebeuren ook in opdracht van provincies of gemeenten.