Via Thematische SBO projecten geeft VLAIO subsidies aan onderzoeksprogramma’s. Het programma betreft vernieuwend onderzoek dat in geval van wetenschappelijk succes een vooruitzicht biedt voor latere economische of maatschappelijke toepassingen (onder de vorm van een nieuwe generatie van producten, processen of diensten). Het betreft uitvoering van onderzoek door onderzoeksorganisaties. De implementatie van de maatschappelijke/economische toepasbaarheid gebeurt door samenwerking met maatschappelijke/economische actoren en transfer van de kennis naar die actoren.